儿科成立于1979年，始终坚持以患儿为中心，以技术标准为规范，融汇中西医学精华，不断提升诊疗水平与服务能力，为儿童健康提供全面、优质、特色的医疗保障。2009年被评定为扬州市中医重点专科，2022年被评为江苏省中医特色专科建设单位，扬州市“十三五”中医药重点学科建设单位，江苏省中医重点专科建设单位，2025年创成江苏省中医重点专科。目前是扬州市中医儿科区域诊疗中心、扬州市中医儿科专业质控中心，负责扬州市中医儿科专业质量控制工作。

儿科目前新病区设有床位40张，共有医生16人，其中主任（中）医师2名，副主任（中）医师5名，其中硕士5人。护理团队共有14人，其中江苏省儿科专科护士1名，江苏省中医专业化护士1名，扬州市专科护士2名，纤支镜护理人员1名。

擅长治疗小儿咳嗽（支气管炎）、小儿咳嗽（肺炎）、肺风痰喘（肺炎）、小儿紫癜（过敏性紫癜）等儿童常见病、多发病、疑难病。

科室特色制剂有麻杏糖浆、银翘上感合剂、止嗽合剂、泻儿康合剂、健脾肥儿糖浆等多个品种，效果显著，儿童适口性好，接受度较高，在本地及周边地区享有较高的知名度和良好口碑，深受患儿家长信赖。

设立有中医综合治疗室，常规开展捏脊疗法治疗婴幼儿脾虚泄泻、冬病夏治穴位敷贴预防肺炎喘嗽、中药外洗治疗小儿紫癜、中药敷脐治疗肺炎相关性泄泻等中医特色技术疗法，开展中药外敷、中药灌肠、揿针、雾化吸入、耳穴埋籽、拔罐、中药外洗等中医特色服务项目。